В данном разделе последовательно и подробно рассматриваются особенности стандартной в Windows 2000 файловой системы — NTfS версии 5.0. Только эта система позволяет в полной мере использовать все возможности Windows 2000, обеспечивающие безопасность и надежность хранения данных на дисковых накопителях. Отдельно в главе 26 рассматривается Encrypting file System (EPS, Шифрующая файловая система), обеспечивающая конфиденциальность файлов. Функционирование EfS также возможно только на NTfS 5.0.